El Elíseo ha confirmado la muerte del yihadista en la operación policial, después de que éste saltara por la ventana del piso en el que permanecía atrincherado. No obstante, su muerte no se debió al salto, dado que la casa es una planta baja. El fiscal jefe de París, François Molins, ha precisado que Merah murió de un disparo en la cabeza efectuado por un francotirador y ha añadido que el asesino grabó los tres ataques y los llegó a subir a Internet.
Poco más tarde de las 10.00 horas, un total de 15 agentes se acercaron al apartamento del yihadista. Algunos se quedaron fuera -vigilando puerta y ventanas- y el resto recorrió habitación por habitación, identificándose.
El homicida se mantenía al fondo, en silencio, atrincherado en el cuarto de baño. Cuando los agentes llegaron a esta estancia, el joven salió y les disparó con un rifle de asalto. A continuación, se acercó al balcón y disparó. Siguió corriendo por el salón disparando y saltó por la ventana mientras no cesaba de apretar el gatillo. Inmediatamente, murió.
